【偷偷卷死小伙伴Pytorch20天】-【day4】-【时间序列数据建模流程范例】
系统教程20天拿下Pytorch
最近和中哥、会哥进行一个小打卡活动,20天pytorch,这是第4天。欢迎一键三连。
文章目录
- 一,准备数据
- 数据处理总结
- 二、定义模型
- 三、训练模型
- 四、评估模型
- 五、使用模型
- 六、保存模型
- 总结
2020年发生的新冠肺炎疫情灾难给各国人民的生活造成了诸多方面的影响。
有的同学是收入上的,有的同学是感情上的,有的同学是心理上的,还有的同学是体重上的。
本文基于中国2020年3月之前的疫情数据,建立时间序列RNN模型,对中国的新冠肺炎疫情结束时间进行预测。
import os
import datetime
import torchkeras#打印时间
def printbar():nowtime = datetime.datetime.now().strftime('%Y-%m-%d %H:%M:%S')print("\n"+"=========="*8 + "%s"%nowtime)#mac系统上pytorch和matplotlib在jupyter中同时跑需要更改环境变量
os.environ["KMP_DUPLICATE_LIB_OK"]="TRUE"
一,准备数据
本文的数据集取自tushare
数据集概览
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
%config InlineBackend.figure_format = 'svg'df = pd.read_csv("/home/mw/input/data6936/eat_pytorch_data/data/covid-19.csv",sep = "\t")
df.plot(x = "date",y = ["confirmed_num","cured_num","dead_num"],figsize=(10,6))
plt.xticks(rotation=60) # 横坐标旋转60°
dfdata = df.set_index("date")
dfdiff = dfdata.diff(periods=1).dropna() # 一阶差分后删掉空值,空值其实也就是第一行
dfdiff = dfdiff.reset_index("date") # 取消date索引身份dfdiff.plot(x = "date",y = ["confirmed_num","cured_num","dead_num"],figsize=(10,6))
plt.xticks(rotation=60)
dfdiff = dfdiff.drop("date",axis = 1).astype("float32") # 删除时间列,并转为浮点型
tips:
df = pd.DataFrame({'month': [1, 4, 7, 10],'year': [2012, 2014, 2013, 2014],'sale': [55, 40, 84, 31]})#设置单个列作为索引
df.set_index('month')
'''year sale
month
1 2012 55
4 2014 40
7 2013 84
10 2014 31
'''
下面我们通过继承torch.utils.data.Dataset实现自定义时间序列数据集。
torch.utils.data.Dataset是一个抽象类,用户想要加载自定义的数据只需要继承这个类,并且覆写其中的两个方法即可:
len:实现len(dataset)返回整个数据集的大小。
getitem:用来获取一些索引的数据,使dataset[i]返回数据集中第i个样本。
不覆写这两个方法会直接返回错误。
import torch
from torch import nn
from torch.utils.data import Dataset,DataLoader,TensorDataset#用某日前8天窗口数据作为输入预测该日数据
WINDOW_SIZE = 8class Covid19Dataset(Dataset):def __len__(self):return len(dfdiff) - WINDOW_SIZEdef __getitem__(self,i):x = dfdiff.loc[i:i+WINDOW_SIZE-1,:]feature = torch.tensor(x.values)y = dfdiff.loc[i+WINDOW_SIZE,:]label = torch.tensor(y.values)return (feature,label)ds_train = Covid19Dataset()#数据较小,可以将全部训练数据放入到一个batch中,提升性能
dl_train = DataLoader(ds_train,batch_size = 38)
import torch
from torch import nn
from torch.utils.data import Dataset,DataLoader,TensorDataset#用某日前8天窗口数据作为输入预测该日数据
WINDOW_SIZE = 8class Covid19Dataset(Dataset):def __len__(self):return len(dfdiff) - WINDOW_SIZEdef __getitem__(self,i):x = dfdiff.loc[i:i+WINDOW_SIZE-1,:]feature = torch.tensor(x.values)y = dfdiff.loc[i+WINDOW_SIZE,:]label = torch.tensor(y.values)return (feature,label)ds_train = Covid19Dataset()#数据较小,可以将全部训练数据放入到一个batch中,提升性能
dl_train = DataLoader(ds_train,batch_size = 38)
数据处理总结
- 时间序列数据,就是用前面时间的数据预测后面的数据
- 对数据进行一阶差分,然后去掉NaN值,构建dataset(用前八天的数据当做训练集)
二、定义模型
使用Pytorch通常有三种方式构建模型:
- 使用nn.Sequential按层顺序构建模型
- 继承nn.Module基类构建自定义模型
- 继承nn.Module基类构建模型并辅助应用模型容器进行封装。
此处选择第二种方式构建模型。
由于接下来使用类形式的训练循环,我们进一步将模型封装成torchkeras中的Model类来获得类似Keras中高阶模型接口的功能。
Model类实际上继承自nn.Module类。
import torch
from torch import nn
import importlib
import torchkeras torch.random.seed()class Block(nn.Module):def __init__(self):super(Block,self).__init__()def forward(self,x,x_input):x_out = torch.max((1+x)*x_input[:,-1,:],torch.tensor(0.0))return x_outclass Net(nn.Module):def __init__(self):super(Net, self).__init__()# 3层lstmself.lstm = nn.LSTM(input_size = 3,hidden_size = 3,num_layers = 5,batch_first = True)self.linear = nn.Linear(3,3)self.block = Block()def forward(self,x_input):x = self.lstm(x_input)[0][:,-1,:] # 不要序列的长度维度x = self.linear(x)y = self.block(x,x_input)return ynet = Net()
model = torchkeras.Model(net) # 魔鬼细节
print(model)model.summary(input_shape=(8,3),input_dtype = torch.FloatTensor)
三、训练模型
训练Pytorch通常需要用户编写自定义训练循环,训练循环的代码风格因人而异。
有3类典型的训练循环代码风格:脚本形式训练循环,函数形式训练循环,类形式训练循环。
此处介绍一种类形式的训练循环。
我们仿照Keras定义了一个高阶的模型接口Model,实现 fit, validate,predict, summary 方法,相当于用户自定义高阶API。
注:循环神经网络调试较为困难,需要设置多个不同的学习率多次尝试,以取得较好的效果。
def mspe(y_pred,y_true):err_percent = (y_true - y_pred)**2/(torch.max(y_true**2,torch.tensor(1e-7)))return torch.mean(err_percent)model.compile(loss_func = mspe,optimizer = torch.optim.Adagrad(model.parameters(),lr = 0.1))
def mspe(y_pred,y_true):err_percent = (y_true - y_pred)**2/(torch.max(y_true**2,torch.tensor(1e-7)))return torch.mean(err_percent)model.compile(loss_func = mspe,optimizer = torch.optim.Adagrad(model.parameters(),lr = 0.1))
dfhistory = model.fit(100,dl_train,log_step_freq=10)
四、评估模型
评估模型一般要设置验证集或者测试集,由于此例数据较少,我们仅仅可视化损失函数在训练集上的迭代情况。
%matplotlib inline
%config InlineBackend.figure_format = 'svg'import matplotlib.pyplot as pltdef plot_metric(dfhistory, metric):train_metrics = dfhistory[metric]epochs = range(1, len(train_metrics) + 1)plt.plot(epochs, train_metrics, 'bo--')plt.title('Training '+ metric)plt.xlabel("Epochs")plt.ylabel(metric)plt.legend(["train_"+metric])plt.show()
plot_metric(dfhistory,"loss")
五、使用模型
此处我们使用模型预测疫情结束时间,即 新增确诊病例为0 的时间。
#使用dfresult记录现有数据以及此后预测的疫情数据
dfresult = dfdiff[["confirmed_num","cured_num","dead_num"]].copy()
dfresult.tail()
#预测此后500天的新增走势,将其结果添加到dfresult中
for i in range(500):arr_input = torch.unsqueeze(torch.from_numpy(dfresult.values[-38:,:]),axis=0)arr_predict = model.forward(arr_input)dfpredict = pd.DataFrame(torch.floor(arr_predict).data.numpy(),columns = dfresult.columns)dfresult = dfresult.append(dfpredict,ignore_index=True)
tips:
torch.unsqueeze(torch.from_numpy(dfresult.values[-38:,:]),axis=0) 在第0维度上增加一维
torch.floor向下取整
dfresult.query("confirmed_num==0").head()# 第50天开始新增确诊降为0,第45天对应3月10日,也就是5天后,即预计3月15日新增确诊降为0
# 注:该预测偏乐观
dfresult.query("cured_num==0").head()# 第186天开始新增治愈降为0,即大概1年后。
# 注: 该预测偏悲观,并且存在问题,如果将每天新增治愈人数加起来,将超过累计确诊人数。
六、保存模型
# 保存模型参数torch.save(model.net.state_dict(), "./data/model_parameter.pkl")net_clone = Net()
net_clone.load_state_dict(torch.load("./data/model_parameter.pkl"))
model_clone = torchkeras.Model(net_clone)
model_clone.compile(loss_func = mspe)# 评估模型
model_clone.evaluate(dl_train)
tips
这里有个魔鬼细节,
net_clone = Net()
net_clone.load_state_dict(torch.load("./data/model_parameter.pkl"))
model_clone = torchkeras.Model(net_clone)
不能颠倒顺序,否则报错,实际上不用torchkeras一样训练保存
总结
-
数据预处理没啥东西,只是用前8天的数据预测后一天的数据
-
模型搭建的时候LSTM的输入输出很重要
-
使用torchkeras时候注意模型加载顺序
这里有个坑我没理解
我不理解这个层为何要这么设计
下挖个坑以后来填
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2024/5/2 9:07:46 - 械字号医用眼膜缓解用眼过度到底有无作用?
原标题:械字号医用眼膜缓解用眼过度到底有无作用?医用眼膜/械字号眼膜/医用冷敷眼贴 凝胶层为亲水高分子材料,含70%以上的水分。体表皮肤温度传导到本产品的凝胶层,热量被凝胶内水分子吸收,通过水分的蒸发带走大量的热量,可迅速地降低体表皮肤局部温度,减轻局部皮肤的灼…...
2024/4/30 9:42:49 - 配置失败还原请勿关闭计算机,电脑开机屏幕上面显示,配置失败还原更改 请勿关闭计算机 开不了机 这个问题怎么办...
解析如下:1、长按电脑电源键直至关机,然后再按一次电源健重启电脑,按F8健进入安全模式2、安全模式下进入Windows系统桌面后,按住“winR”打开运行窗口,输入“services.msc”打开服务设置3、在服务界面,选中…...
2022/11/19 21:17:18 - 错误使用 reshape要执行 RESHAPE,请勿更改元素数目。
%读入6幅图像(每一幅图像的大小是564*564) f1 imread(WashingtonDC_Band1_564.tif); subplot(3,2,1),imshow(f1); f2 imread(WashingtonDC_Band2_564.tif); subplot(3,2,2),imshow(f2); f3 imread(WashingtonDC_Band3_564.tif); subplot(3,2,3),imsho…...
2022/11/19 21:17:16 - 配置 已完成 请勿关闭计算机,win7系统关机提示“配置Windows Update已完成30%请勿关闭计算机...
win7系统关机提示“配置Windows Update已完成30%请勿关闭计算机”问题的解决方法在win7系统关机时如果有升级系统的或者其他需要会直接进入一个 等待界面,在等待界面中我们需要等待操作结束才能关机,虽然这比较麻烦,但是对系统进行配置和升级…...
2022/11/19 21:17:15 - 台式电脑显示配置100%请勿关闭计算机,“准备配置windows 请勿关闭计算机”的解决方法...
有不少用户在重装Win7系统或更新系统后会遇到“准备配置windows,请勿关闭计算机”的提示,要过很久才能进入系统,有的用户甚至几个小时也无法进入,下面就教大家这个问题的解决方法。第一种方法:我们首先在左下角的“开始…...
2022/11/19 21:17:14 - win7 正在配置 请勿关闭计算机,怎么办Win7开机显示正在配置Windows Update请勿关机...
置信有很多用户都跟小编一样遇到过这样的问题,电脑时发现开机屏幕显现“正在配置Windows Update,请勿关机”(如下图所示),而且还需求等大约5分钟才干进入系统。这是怎样回事呢?一切都是正常操作的,为什么开时机呈现“正…...
2022/11/19 21:17:13 - 准备配置windows 请勿关闭计算机 蓝屏,Win7开机总是出现提示“配置Windows请勿关机”...
Win7系统开机启动时总是出现“配置Windows请勿关机”的提示,没过几秒后电脑自动重启,每次开机都这样无法进入系统,此时碰到这种现象的用户就可以使用以下5种方法解决问题。方法一:开机按下F8,在出现的Windows高级启动选…...
2022/11/19 21:17:12 - 准备windows请勿关闭计算机要多久,windows10系统提示正在准备windows请勿关闭计算机怎么办...
有不少windows10系统用户反映说碰到这样一个情况,就是电脑提示正在准备windows请勿关闭计算机,碰到这样的问题该怎么解决呢,现在小编就给大家分享一下windows10系统提示正在准备windows请勿关闭计算机的具体第一种方法:1、2、依次…...
2022/11/19 21:17:11 - 配置 已完成 请勿关闭计算机,win7系统关机提示“配置Windows Update已完成30%请勿关闭计算机”的解决方法...
今天和大家分享一下win7系统重装了Win7旗舰版系统后,每次关机的时候桌面上都会显示一个“配置Windows Update的界面,提示请勿关闭计算机”,每次停留好几分钟才能正常关机,导致什么情况引起的呢?出现配置Windows Update…...
2022/11/19 21:17:10 - 电脑桌面一直是清理请关闭计算机,windows7一直卡在清理 请勿关闭计算机-win7清理请勿关机,win7配置更新35%不动...
只能是等着,别无他法。说是卡着如果你看硬盘灯应该在读写。如果从 Win 10 无法正常回滚,只能是考虑备份数据后重装系统了。解决来方案一:管理员运行cmd:net stop WuAuServcd %windir%ren SoftwareDistribution SDoldnet start WuA…...
2022/11/19 21:17:09 - 计算机配置更新不起,电脑提示“配置Windows Update请勿关闭计算机”怎么办?
原标题:电脑提示“配置Windows Update请勿关闭计算机”怎么办?win7系统中在开机与关闭的时候总是显示“配置windows update请勿关闭计算机”相信有不少朋友都曾遇到过一次两次还能忍但经常遇到就叫人感到心烦了遇到这种问题怎么办呢?一般的方…...
2022/11/19 21:17:08 - 计算机正在配置无法关机,关机提示 windows7 正在配置windows 请勿关闭计算机 ,然后等了一晚上也没有关掉。现在电脑无法正常关机...
关机提示 windows7 正在配置windows 请勿关闭计算机 ,然后等了一晚上也没有关掉。现在电脑无法正常关机以下文字资料是由(历史新知网www.lishixinzhi.com)小编为大家搜集整理后发布的内容,让我们赶快一起来看一下吧!关机提示 windows7 正在配…...
2022/11/19 21:17:05 - 钉钉提示请勿通过开发者调试模式_钉钉请勿通过开发者调试模式是真的吗好不好用...
钉钉请勿通过开发者调试模式是真的吗好不好用 更新时间:2020-04-20 22:24:19 浏览次数:729次 区域: 南阳 > 卧龙 列举网提醒您:为保障您的权益,请不要提前支付任何费用! 虚拟位置外设器!!轨迹模拟&虚拟位置外设神器 专业用于:钉钉,外勤365,红圈通,企业微信和…...
2022/11/19 21:17:05 - 配置失败还原请勿关闭计算机怎么办,win7系统出现“配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机”,长时间没反应,无法进入系统的解决方案...
前几天班里有位学生电脑(windows 7系统)出问题了,具体表现是开机时一直停留在“配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机”这个界面,长时间没反应,无法进入系统。这个问题原来帮其他同学也解决过,网上搜了不少资料&#x…...
2022/11/19 21:17:04 - 一个电脑无法关闭计算机你应该怎么办,电脑显示“清理请勿关闭计算机”怎么办?...
本文为你提供了3个有效解决电脑显示“清理请勿关闭计算机”问题的方法,并在最后教给你1种保护系统安全的好方法,一起来看看!电脑出现“清理请勿关闭计算机”在Windows 7(SP1)和Windows Server 2008 R2 SP1中,添加了1个新功能在“磁…...
2022/11/19 21:17:03 - 请勿关闭计算机还原更改要多久,电脑显示:配置windows更新失败,正在还原更改,请勿关闭计算机怎么办...
许多用户在长期不使用电脑的时候,开启电脑发现电脑显示:配置windows更新失败,正在还原更改,请勿关闭计算机。。.这要怎么办呢?下面小编就带着大家一起看看吧!如果能够正常进入系统,建议您暂时移…...
2022/11/19 21:17:02 - 还原更改请勿关闭计算机 要多久,配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机,电脑开机后一直显示以...
配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机,电脑开机后一直显示以以下文字资料是由(历史新知网www.lishixinzhi.com)小编为大家搜集整理后发布的内容,让我们赶快一起来看一下吧!配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机&#x…...
2022/11/19 21:17:01 - 电脑配置中请勿关闭计算机怎么办,准备配置windows请勿关闭计算机一直显示怎么办【图解】...
不知道大家有没有遇到过这样的一个问题,就是我们的win7系统在关机的时候,总是喜欢显示“准备配置windows,请勿关机”这样的一个页面,没有什么大碍,但是如果一直等着的话就要两个小时甚至更久都关不了机,非常…...
2022/11/19 21:17:00 - 正在准备配置请勿关闭计算机,正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了解决教程...
当电脑出现正在准备配置windows请勿关闭计算机时,一般是您正对windows进行升级,但是这个要是长时间没有反应,我们不能再傻等下去了。可能是电脑出了别的问题了,来看看教程的说法。正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了方法一…...
2022/11/19 21:16:59 - 配置失败还原请勿关闭计算机,配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机...
我们使用电脑的过程中有时会遇到这种情况,当我们打开电脑之后,发现一直停留在一个界面:“配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机”,等了许久还是无法进入系统。如果我们遇到此类问题应该如何解决呢࿰…...
2022/11/19 21:16:58 - 如何在iPhone上关闭“请勿打扰”
Apple’s “Do Not Disturb While Driving” is a potentially lifesaving iPhone feature, but it doesn’t always turn on automatically at the appropriate time. For example, you might be a passenger in a moving car, but your iPhone may think you’re the one dri…...
2022/11/19 21:16:57