使用python的pydicom模块对DICOMDIR文件进行操作,将混合存储的DICOM图像转化为分层存储
混合存储的DICOM图像,包含多个病人,多个研究次数(检查次数),多个和多个序列,多个图像。
但多个病人和多个序列的图像混在一起存放,较难分辨哪些图片属于同一个病人。
可以根据配套的DICOMDIR文件,使用python的pydicom模块对DICOMDIR文件进行操作,将上述DICOM图像转化为分层存储。
运行前务必先备份原文件,偶尔会因DICOM图像所在的目录名错误,导致程序中止
唯一需要修改的地方是第7行path = ‘ ’
中填写DICOMDIR文件的地址,如C:\DICOMDIR
import os
from os.path import dirname, join
import shutil
import pydicom
from pydicom.filereader import read_dicomdirpath = ‘’
dicom_dir = read_dicomdir(path)
base_dir = dirname(path)for patient_record in dicom_dir.patient_records: # got through each patientpath1 = os.path.join(base_dir, patient_record.PatientName.family_name)#拼接目录os.mkdir(path1) # 创建目录##中间调试可使用,下同## try: os.mkdir(path1)## except FileExistsError: passstudies = patient_record.children # got through each studyfor study in studies:path2 = os.path.join(path1, study.StudyID)os.mkdir(path2) # 创建目录all_series = study.children # go through each seriefor series in all_series:series.SeriesDescription = series.SeriesDescription.replace(":", "") #序列偶尔存在冒号和空格,去掉series.SeriesDescription = series.SeriesDescription.replace(" ", "")path3 = os.path.join(path2, series.SeriesDescription)os.mkdir(path3) # 创建目录 image_records = series.children # go through each imageimage_filenames = [join(base_dir, *image_rec.ReferencedFileID) for image_rec in image_records]for image_filename in image_filenames:shutil.move(image_filename, path3)#移动文件
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2022/11/19 21:17:01 - 电脑配置中请勿关闭计算机怎么办,准备配置windows请勿关闭计算机一直显示怎么办【图解】...
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2022/11/19 21:17:00 - 正在准备配置请勿关闭计算机,正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了解决教程...
当电脑出现正在准备配置windows请勿关闭计算机时,一般是您正对windows进行升级,但是这个要是长时间没有反应,我们不能再傻等下去了。可能是电脑出了别的问题了,来看看教程的说法。正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了方法一…...
2022/11/19 21:16:59 - 配置失败还原请勿关闭计算机,配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机...
我们使用电脑的过程中有时会遇到这种情况,当我们打开电脑之后,发现一直停留在一个界面:“配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机”,等了许久还是无法进入系统。如果我们遇到此类问题应该如何解决呢࿰…...
2022/11/19 21:16:58 - 如何在iPhone上关闭“请勿打扰”
Apple’s “Do Not Disturb While Driving” is a potentially lifesaving iPhone feature, but it doesn’t always turn on automatically at the appropriate time. For example, you might be a passenger in a moving car, but your iPhone may think you’re the one dri…...
2022/11/19 21:16:57