Doris存储文件格式优化

#文件格式

文件包括：

文件开始是8个字节的magic code，用于识别文件格式和版本

Data Region：用于存储各个列的数据信息，这里的数据是按需分page加载的

Index Region: doris中将各个列的index数据统一存储在Index Region，这里的数据会按照列粒度进行加载，所以跟列的数据信息分开存储

Footer信息
FileFooterPB:定义文件的元数据信息
4个字节的footer pb内容的checksum
4个字节的FileFooterPB消息长度，用于读取FileFooterPB
8个字节的MAGIC CODE，之所以在末位存储，是方便不同的场景进行文件类型的识别

文件中的数据按照page的方式进行组织，page是编码和压缩的基本单位。现在的page类型包括以下几种:

DataPage

DataPage分为两种：nullable和non-nullable的data page。

nullable的data page内容包括：+----------------+|  value count   ||----------------||  first row id  ||----------------|| bitmap length  ||----------------||  null bitmap   ||----------------||     data       ||----------------||    checksum    |+----------------+
non-nullable data page结构如下：|----------------||   value count  ||----------------||  first row id  ||----------------||     data       ||----------------||    checksum    |+----------------+

其中各个字段含义如下：

value count
表示page中的行数

first row id
page中第一行的行号

bitmap length
表示接下来bitmap的字节数

null bitmap
表示null信息的bitmap

data
存储经过encoding和compress之后的数据

需要在数据的头部信息中写入：is_compressed

各种不同编码的data需要在头部信息写入一些字段信息，以实现数据的解析

TODO：添加各种encoding的header信息
checksum
存储page粒度的校验和，包括page的header和之后的实际数据

Bloom Filter Pages

针对每个bloom filter列,会在page的粒度相应的生成一个bloom filter的page，保存在bloom filter pages区域

Ordinal Index Page

针对每个列，都会按照page粒度，建立行号的稀疏索引。内容为这个page的起始行的行号到这个block的指针（包括offset和length）

Short Key Index page

我们会每隔N行（可配置）生成一个short key的稀疏索引，索引的内容为：short key->行号(ordinal)

Column的其他索引

该格式设计支持后续扩展其他的索引信息，比如bitmap索引，spatial索引等等，只需要将需要的数据写到现有的列数据后面，并且添加对应的元数据字段到FileFooterPB中

元数据定义

SegmentFooterPB的定义为：message ColumnPB {required int32 unique_id = 1;   // 这里使用column id, 不使用column name是因为计划支持修改列名optional string name = 2;   // 列的名字,  当name为__DORIS_DELETE_SIGN__, 表示该列为隐藏的删除列required string type = 3;   // 列类型optional bool is_key = 4;   // 是否是主键列optional string aggregation = 5;    // 聚合方式optional bool is_nullable = 6;      // 是否有nulloptional bytes default_value = 7;   // 默认值optional int32 precision = 8;       // 精度optional int32 frac = 9;optional int32 length = 10;         // 长度optional int32 index_length = 11;   // 索引长度optional bool is_bf_column = 12;    // 是否有bf词典optional bool has_bitmap_index = 15 [default=false];  // 是否有bitmap索引
}// page偏移
message PagePointerPB {required uint64 offset; // page在文件中的偏移required uint32 length; // page的大小
}message MetadataPairPB {optional string key = 1;optional bytes value = 2;
}message ColumnMetaPB {optional ColumnMessage encoding; // 编码方式optional PagePointerPB dict_page // 词典pagerepeated PagePointerPB bloom_filter_pages; // bloom filter词典信息optional PagePointerPB ordinal_index_page; // 行号索引数据optional PagePointerPB page_zone_map_page; // page级别统计信息索引数据optional PagePointerPB bitmap_index_page; // bitmap索引数据optional uint64 data_footprint; // 列中索引的大小optional uint64 index_footprint; // 列中数据的大小optional uint64 raw_data_footprint; // 原始列数据大小optional CompressKind compress_kind; // 列的压缩方式optional ZoneMapPB column_zone_map; //文件级别的过滤条件repeated MetadataPairPB column_meta_datas;
}message SegmentFooterPB {optional uint32 version = 2 [default = 1]; // 用于版本兼容和升级使用repeated ColumnPB schema = 5; // 列Schemaoptional uint64 num_values = 4; // 文件中保存的行数optional uint64 index_footprint = 7; // 索引大小optional uint64 data_footprint = 8; // 数据大小optional uint64 raw_data_footprint = 8; // 原始数据大小optional CompressKind compress_kind = 9 [default = COMPRESS_LZO]; // 压缩方式repeated ColumnMetaPB column_metas = 10; // 列元数据optional PagePointerPB key_index_page; // short key索引page
}

读写逻辑

写入

大体的写入流程如下：

写入magic
根据schema信息，生成对应的ColumnWriter，每个ColumnWriter按照不同的类型，获取对应的encoding信息（可配置），根据encoding，生成对应的encoder
调用encoder->add(value)进行数据写入，每个K行，生成一个short key index entry，并且，如果当前的page满足一定条件（大小超过1M或者行数为K），就生成一个新的page，缓存在内存中。
不断的循环步骤3，直到数据写入完成。将各个列的数据依序刷入文件中
生成FileFooterPB信息，写入文件中。
相关的问题：

short key的索引如何生成？

现在还是按照每隔多少行生成一个short key的稀疏索引，保持每隔1024行生成一个short的稀疏索引,具体的内容是：short key -> ordinal
ordinal索引里面应该存什么？

存储page的第一个ordinal到page pointer的映射信息
不同encoding类型的page里存什么？

词典压缩
plain
rle
bshuf

读取

读取文件的magic，判断文件类型和版本
读取FileFooterPB，进行checksum校验
按照需要的列，读取short key索引和对应列的数据ordinal索引信息
使用start key和end key，通过short key索引定位到要读取的行号，然后通过ordinal索引确定需要读取的row ranges, 同时需要通过统计信息、bitmap索引等过滤需要读取的row ranges
然后按照row ranges通过ordinal索引读取行的数据
相关的问题：

如何实现在page内部快速的定位到某一行？

page内部是的数据是经过encoding的，无法快速进行行级数据的定位。不同的encoding方式，在内部进行快速的行号定位的方案不一样，需要具体分析：

如果是rle编码的，需要通过解析rle的header进行skip，直到到达包含该行的那个rle块之后，再进行反解。
binary plain encoding：会在page的中存储offset信息，并且会在page header中指定offset信息的offset，读取的时候会先解析offset信息到数组中，这样子就可以通过各个行的offset数据信息快速的定位block某一行的数据
如何实现块的高效读取？可以考虑将相邻的块在读取的时候进行merge，一次性读取？ 这个需要在读取的时候，判断block是否连续，如果连续，就一次性的读取

编码

现有的doris存储中，针对string类型的编码，采用plain encoding的方式，效率比较低。经过对比，发现在百度统计的场景下，数据会因为string类型的编码膨胀超过一倍。所以，计划引入基于词典的编码压缩。

压缩

实现可扩展的压缩框架，支持多种压缩算法，方便后续添加新的压缩算法，计划引入zstd压缩