【细胞分割】基于阙值+边缘+形态学+种子点图像分割matlab源码含 GUI
一、简介
模型参考这里。
二、源代码
function varargout = bishe2(varargin) % BISHE2 MATLAB code for bishe2.fig % BISHE2, by itself, creates a new BISHE2 or raises the existing % singleton*. % % H = BISHE2 returns the handle to a new BISHE2 or the handle to % the existing singleton*. % % BISHE2('CALLBACK',hObject,eventData,handles,...) calls the local % function named CALLBACK in BISHE2.M with the given input arguments. % % BISHE2('Property','Value',...) creates a new BISHE2 or raises the % existing singleton*. Starting from the left, property value pairs are % applied to the GUI before bishe2_OpeningFcn gets called. An % unrecognized property name or invalid value makes property application % stop. All inputs are passed to bishe2_OpeningFcn via varargin. % % *See GUI Options on GUIDE's Tools menu. Choose "GUI allows only one % instance to run (singleton)". % % See also: GUIDE, GUIDATA, GUIHANDLES% Edit the above text to modify the response to help bishe2% Last Modified by GUIDE v2.5 26-Nov-2020 16:50:25% Begin initialization code - DO NOT EDIT gui_Singleton = 1; gui_State = struct('gui_Name', mfilename, ...'gui_Singleton', gui_Singleton, ...'gui_OpeningFcn', @bishe2_OpeningFcn, ...'gui_OutputFcn', @bishe2_OutputFcn, ...'gui_LayoutFcn', [] , ...'gui_Callback', []); if nargin && ischar(varargin{1})gui_State.gui_Callback = str2func(varargin{1}); endif nargout[varargout{1:nargout}] = gui_mainfcn(gui_State, varargin{:}); elsegui_mainfcn(gui_State, varargin{:}); end% End initialization code - DO NOT EDIT% --- Executes just before bishe2 is made visible. function bishe2_OpeningFcn(hObject, eventdata, handles, varargin) % This function has no output args, see OutputFcn. % hObject handle to figure % eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB % handles structure with handles and user data (see GUIDATA) % varargin command line arguments to bishe2 (see VARARGIN)% Choose default command line output for bishe2 handles.output = hObject;% Update handles structure guidata(hObject, handles);% UIWAIT makes bishe2 wait for user response (see UIRESUME) % uiwait(handles.figure1);% --- Outputs from this function are returned to the command line. function varargout = bishe2_OutputFcn(hObject, eventdata, handles) % varargout cell array for returning output args (see VARARGOUT); % hObject handle to figure % eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB % handles structure with handles and user data (see GUIDATA)% Get default command line output from handles structure varargout{1} = handles.output;% --- Executes on button press in pushbutton1. %% 按钮实现打开文件功能 function pushbutton1_Callback(hObject, eventdata, handles) % hObject handle to pushbutton1 (see GCBO) % eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB % handles structure with handles and user data (see GUIDATA) global yuantu; %文件打开对话框 [filename,pathname]=uigetfile({'*.bmp';'*.jpg';'*.gif'},'选择图片'); if isequal(filename,0)|isequal(pathname,0)errordlg('没有打开图像','出错'); return; else file=[pathname,filename]; yuantu=imread(file);%读入图像 %设置显示的坐标轴 axes(handles.axes1); %显示图像 imshow(yuantu);title('原始图像'); end% --- Executes on button press in pushbutton2. %% 按钮实现图像灰度化 function pushbutton2_Callback(hObject, eventdata, handles) % hObject handle to pushbutton2 (see GCBO) % eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB % handles structure with handles and user data (see GUIDATA) global yuantu; axes(handles.axes2); f= rgb2gray(yuantu); imshow(f);title('灰度图像');% --- Executes on button press in pushbutton3. %% 按钮实现基于阈值的细胞分割算法 function pushbutton3_Callback(hObject, eventdata, handles) % hObject handle to pushbutton3 (see GCBO) % eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB % handles structure with handles and user data (see GUIDATA) global yuantu; axes(handles.axes3); %%%%%%%%%%%%%%%大松算法 level=graythresh(yuantu); %确定灰度阈值 BW=im2bw(yuantu,level); imshow(BW); title('基于阈值的细胞分割');% --- Executes on button press in pushbutton4. %% 按钮实现基于边缘的细胞分割算法 function pushbutton4_Callback(hObject, eventdata, handles) % hObject handle to pushbutton4 (see GCBO) % eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB % handles structure with handles and user data (see GUIDATA) global yuantu; %将axes4作为当前的坐标轴 axes(handles.axes4); %获取popupmenu1的句柄为c c=get(handles.popupmenu1,'value'); f=im2bw(yuantu); [g_sobel_default , ts] = edge(f, 'sobel'); [g_log_default,tlog]=edge(f, 'log'); [g_canny_default,tc]=edge(f, 'canny' ); [g_prewitt_default,tp]=edge(f, 'prewitt'); [g_roberts_default,tr]=edge(f, 'roberts' ); g_sobel_best=edge(f, 'sobel' ,0.25); g_log_best=edge(f, 'log',0.003,2.25); g_canny_best=edge(f, 'canny' ,[0.04 0.10],1.5); switch ccase 1 %使用sobel算子边缘检测 imshow(g_sobel_default);title('sobel图像边缘提取(自动阈值)');case 2 %使用log特算子边缘检测 imshow(g_log_default);title('log图像边缘提取(自动阈值)');case 3 %使用canny算子边缘检测imshow(g_canny_default);title('canny图像边缘提取(自动阈值)');case 4 %使用log特算子边缘检测 imshow(g_prewitt_default);title('prewitt图像边缘提取(自动阈值)');case 5 %使用canny算子边缘检测imshow(g_roberts_default);title('Roberts图像边缘提取(自动阈值)');case 6 %使用sobel算子边缘检测 imshow(g_sobel_best);title('sobel算子边缘检测');case 7 %使用log特算子边缘检测 imshow(g_log_best);title('log算子边缘检测');case 8 %使用canny算子边缘检测imshow(g_canny_best);title('canny算子边缘检测');case 9blood=rgb2gray(yuantu);[m,n]=size(blood); % 求出图象大小b=double(blood); % 将blood转为双精度浮点类型N =sqrt(100) * randn(m,n); % 生成方差为10的白噪声I=b+N; % 噪声干扰图象z0=max(max(I)); % 求出图象中最大的灰度z1=min(min(I)); % 最小的灰度 T=(z0+z1)/2; % 求最大和最小灰度的平均值TT=0;S0=0; n0=0;S1=0; n1=0;allow=0.5; % 新旧阈值的允许接近程度d=abs(T-TT); % 数的绝对值count=0; % 记录几次循环while(d>=allow) % 迭代最佳阈值分割算法count=count+1;for i=1:mfor j=1:nif (I(i,j)>=T)S0=S0+I(i,j); % 图像中各个大于平均灰度值的点的灰度之和n0=n0+1; % 图像中各个大于平均灰度值的点的总数endif (I(i,j)<T) S1=S1+I(i,j); % 图像中各个小于平均灰度值的点的灰度之和n1=n1+1; % 图像中各个小于平均灰度值的点的总数endendend T0=S0/n0; % 所有大于平均灰度值的点的平均灰度值T1=S1/n1; % 所有小于平均灰度值的点的平均灰度值TT=(T0+T1)/2; % 平均值d=abs(T-TT); % 两个平均值的差T=TT;endSeg=zeros(m,n);for i=1:mfor j=1:nif(I(i,j)>=T)Seg(i,j)=1; % 阈值分割的图象endendendSI=1-Seg; % 阈值分割后的图象求反,便于用腐蚀算法求边缘se1=strel('square',3); % 定义腐蚀算法的结构 strel是构建形态学运算中的结构元素函数SI1=imerode(SI,se1); % 腐蚀算法BW=SI-SI1; % 边缘检测imshow(BW);title('New algorithm');end% --- Executes on button press in pushbutton5. %% 按钮实现基于形态学的细胞分割算法 来提取边界 function pushbutton5_Callback(hObject, eventdata, handles) % hObject handle to pushbutton5 (see GCBO) % eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB % handles structure with handles and user data (see GUIDATA) global yuantu; num=0; % 图像位置计数 rowi=3; % 图像显示行数 colui=3; % 图像显示列数 %%%%%%%%%%% 读入图像 %%%%%%% I=yuantu; num=num+1;figure(1),subplot(rowi,colui,num),imshow(I),title('原图'); % 显示 %%%%%%%%%% 程序开始,计算时间 %%%%%%%%%% tic % tic 和 toc 为程序运行时间的计算 %%%%%%%%%% 灰度化 %%%%%%%%%% Igray = rgb2gray(I); num=num+1;figure(1),subplot(rowi,colui,num),imshow(Igray),title('灰度化'); %%%%%%%%%% 填充--灰度重构 %%%%%%%%%% Ifill = imfill(Igray,'holes');%填充二值图像中的空洞区域。 如,黑色的背景上有个白色的圆圈。则这个圆圈内区域将被填充。 num=num+1;figure(1),subplot(rowi,colui,num),imshow(Ifill),title('灰度重构'); %%%%%% 二值化阈值选取过程 %%%%% %%% 第一步,淋巴细胞不会在视场边缘,因此选择处理比视场小的图像范围,减少背景 [m,n]=size(Ifill); % 图像大小 Ifilltest=Ifill(40:m-50,60:n-50); % 40-238,60-302 %%% 第二步,直方图 [yout,xx]=imhist(Ifilltest); % yout为统计的个数,xx为相应的灰度值 num=num+1;figure(1),subplot(rowi,colui,num),imhist(Ifilltest),title('直方图'); %%% 重构后淋巴细胞的灰度比白细胞灰度低,因此选择灰度低于220的直方图中的最大值 %%% 对应的灰度作为阈值 %%% 重构的时候,只在闭合区域进行填充--设置成相同的灰度值,不同区域设置成不同的灰度 %%% 虽然背景区域看上去比目标区域大,但是未闭合,未填充,没有相同的灰度值,虽然看上去灰度比较相近,但是,灰度值不同 %%% 因此,在选择阈值的时候,还是选择最大区域的灰度作为阈值 yout = yout(1:255); % 可以修改,保证重构之后的目标灰度在所选范围内 [yy,P]=max(yout); % yy返回直方图最高的个数,P为相应灰度值 P = P-1; % P即为阈值 %%%%%%%%%% 二值化 %%%%%%%%%% Ib = binarize1(Ifill,P); % 自编函数binarize1 num=num+1;figure(1),subplot(rowi,colui,num),imshow(Ib),title('二值化'); %%%%%%%%%% 去小区域 %%%%%%%%%%% Io = bwareaopen(Ib, 500); % 形态学开运算,去小区域 num=num+1;figure(1),subplot(rowi,colui,num),imshow(Io),title('去小区域'); %%%%%%%%%% 填充孔洞 %%%%%%%%%%% Iend = imfill(Io,'holes'); num=num+1;figure(1),subplot(rowi,colui,num),imshow(Iend),title('填充孔洞'); % 此时I中白色区域,即为淋巴细胞所在的区域 % 先找到像素最多的一列,即最长的一列 [H, col] = max(sum(Iend)); % 对每一列求和,H为最大值,col为所在行 % 再找到该列上最低点 row = min(find(Iend(:, col))); %row = find(I(:, col),'first'); % [row, col]为求边界曲线的初始点 boundary = bwtraceboundary(Iend, [row, col], 'N'); % 找出图像的边界点坐
三、运行结果
四、参考文献
[1]张羽, 徐端全. OpenCV分水岭算法的改进及其在细胞分割中的应用[J]. 计算机应用, 2012, 32(S1):134-136.
博主简介:擅长智能优化算法、神经网络预测、信号处理、元胞自动机、图像处理、路径规划、无人机等多种领域的Matlab仿真,相关matlab代码问题可私信交流。
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原标题:「发现」铁皮石斛仙草之神奇功效用于医用面膜丽彦妆铁皮石斛医用面膜|石斛多糖无菌修护补水贴19大优势: 1、铁皮石斛:自唐宋以来,一直被列为皇室贡品,铁皮石斛生于海拔1600米的悬崖峭壁之上,繁殖力差,产量极低,所以古代仅供皇室、贵族享用 2、铁皮石斛自古民间…...
2024/4/28 5:48:52 - 丽彦妆\医用面膜\冷敷贴轻奢医学护肤引导者
原标题:丽彦妆\医用面膜\冷敷贴轻奢医学护肤引导者【公司简介】 广州华彬企业隶属香港华彬集团有限公司,专注美业21年,其旗下品牌: 「圣茵美」私密荷尔蒙抗衰,产后修复 「圣仪轩」私密荷尔蒙抗衰,产后修复 「花茵莳」私密荷尔蒙抗衰,产后修复 「丽彦妆」专注医学护…...
2024/4/30 9:42:22 - 广州械字号面膜生产厂家OEM/ODM4项须知!
原标题:广州械字号面膜生产厂家OEM/ODM4项须知!广州械字号面膜生产厂家OEM/ODM流程及注意事项解读: 械字号医用面膜,其实在我国并没有严格的定义,通常我们说的医美面膜指的应该是一种「医用敷料」,也就是说,医用面膜其实算作「医疗器械」的一种,又称「医用冷敷贴」。 …...
2024/5/2 9:07:46 - 械字号医用眼膜缓解用眼过度到底有无作用?
原标题:械字号医用眼膜缓解用眼过度到底有无作用?医用眼膜/械字号眼膜/医用冷敷眼贴 凝胶层为亲水高分子材料,含70%以上的水分。体表皮肤温度传导到本产品的凝胶层,热量被凝胶内水分子吸收,通过水分的蒸发带走大量的热量,可迅速地降低体表皮肤局部温度,减轻局部皮肤的灼…...
2024/4/30 9:42:49 - 配置失败还原请勿关闭计算机,电脑开机屏幕上面显示,配置失败还原更改 请勿关闭计算机 开不了机 这个问题怎么办...
解析如下:1、长按电脑电源键直至关机,然后再按一次电源健重启电脑,按F8健进入安全模式2、安全模式下进入Windows系统桌面后,按住“winR”打开运行窗口,输入“services.msc”打开服务设置3、在服务界面,选中…...
2022/11/19 21:17:18 - 错误使用 reshape要执行 RESHAPE,请勿更改元素数目。
%读入6幅图像(每一幅图像的大小是564*564) f1 imread(WashingtonDC_Band1_564.tif); subplot(3,2,1),imshow(f1); f2 imread(WashingtonDC_Band2_564.tif); subplot(3,2,2),imshow(f2); f3 imread(WashingtonDC_Band3_564.tif); subplot(3,2,3),imsho…...
2022/11/19 21:17:16 - 配置 已完成 请勿关闭计算机,win7系统关机提示“配置Windows Update已完成30%请勿关闭计算机...
win7系统关机提示“配置Windows Update已完成30%请勿关闭计算机”问题的解决方法在win7系统关机时如果有升级系统的或者其他需要会直接进入一个 等待界面,在等待界面中我们需要等待操作结束才能关机,虽然这比较麻烦,但是对系统进行配置和升级…...
2022/11/19 21:17:15 - 台式电脑显示配置100%请勿关闭计算机,“准备配置windows 请勿关闭计算机”的解决方法...
有不少用户在重装Win7系统或更新系统后会遇到“准备配置windows,请勿关闭计算机”的提示,要过很久才能进入系统,有的用户甚至几个小时也无法进入,下面就教大家这个问题的解决方法。第一种方法:我们首先在左下角的“开始…...
2022/11/19 21:17:14 - win7 正在配置 请勿关闭计算机,怎么办Win7开机显示正在配置Windows Update请勿关机...
置信有很多用户都跟小编一样遇到过这样的问题,电脑时发现开机屏幕显现“正在配置Windows Update,请勿关机”(如下图所示),而且还需求等大约5分钟才干进入系统。这是怎样回事呢?一切都是正常操作的,为什么开时机呈现“正…...
2022/11/19 21:17:13 - 准备配置windows 请勿关闭计算机 蓝屏,Win7开机总是出现提示“配置Windows请勿关机”...
Win7系统开机启动时总是出现“配置Windows请勿关机”的提示,没过几秒后电脑自动重启,每次开机都这样无法进入系统,此时碰到这种现象的用户就可以使用以下5种方法解决问题。方法一:开机按下F8,在出现的Windows高级启动选…...
2022/11/19 21:17:12 - 准备windows请勿关闭计算机要多久,windows10系统提示正在准备windows请勿关闭计算机怎么办...
有不少windows10系统用户反映说碰到这样一个情况,就是电脑提示正在准备windows请勿关闭计算机,碰到这样的问题该怎么解决呢,现在小编就给大家分享一下windows10系统提示正在准备windows请勿关闭计算机的具体第一种方法:1、2、依次…...
2022/11/19 21:17:11 - 配置 已完成 请勿关闭计算机,win7系统关机提示“配置Windows Update已完成30%请勿关闭计算机”的解决方法...
今天和大家分享一下win7系统重装了Win7旗舰版系统后,每次关机的时候桌面上都会显示一个“配置Windows Update的界面,提示请勿关闭计算机”,每次停留好几分钟才能正常关机,导致什么情况引起的呢?出现配置Windows Update…...
2022/11/19 21:17:10 - 电脑桌面一直是清理请关闭计算机,windows7一直卡在清理 请勿关闭计算机-win7清理请勿关机,win7配置更新35%不动...
只能是等着,别无他法。说是卡着如果你看硬盘灯应该在读写。如果从 Win 10 无法正常回滚,只能是考虑备份数据后重装系统了。解决来方案一:管理员运行cmd:net stop WuAuServcd %windir%ren SoftwareDistribution SDoldnet start WuA…...
2022/11/19 21:17:09 - 计算机配置更新不起,电脑提示“配置Windows Update请勿关闭计算机”怎么办?
原标题:电脑提示“配置Windows Update请勿关闭计算机”怎么办?win7系统中在开机与关闭的时候总是显示“配置windows update请勿关闭计算机”相信有不少朋友都曾遇到过一次两次还能忍但经常遇到就叫人感到心烦了遇到这种问题怎么办呢?一般的方…...
2022/11/19 21:17:08 - 计算机正在配置无法关机,关机提示 windows7 正在配置windows 请勿关闭计算机 ,然后等了一晚上也没有关掉。现在电脑无法正常关机...
关机提示 windows7 正在配置windows 请勿关闭计算机 ,然后等了一晚上也没有关掉。现在电脑无法正常关机以下文字资料是由(历史新知网www.lishixinzhi.com)小编为大家搜集整理后发布的内容,让我们赶快一起来看一下吧!关机提示 windows7 正在配…...
2022/11/19 21:17:05 - 钉钉提示请勿通过开发者调试模式_钉钉请勿通过开发者调试模式是真的吗好不好用...
钉钉请勿通过开发者调试模式是真的吗好不好用 更新时间:2020-04-20 22:24:19 浏览次数:729次 区域: 南阳 > 卧龙 列举网提醒您:为保障您的权益,请不要提前支付任何费用! 虚拟位置外设器!!轨迹模拟&虚拟位置外设神器 专业用于:钉钉,外勤365,红圈通,企业微信和…...
2022/11/19 21:17:05 - 配置失败还原请勿关闭计算机怎么办,win7系统出现“配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机”,长时间没反应,无法进入系统的解决方案...
前几天班里有位学生电脑(windows 7系统)出问题了,具体表现是开机时一直停留在“配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机”这个界面,长时间没反应,无法进入系统。这个问题原来帮其他同学也解决过,网上搜了不少资料&#x…...
2022/11/19 21:17:04 - 一个电脑无法关闭计算机你应该怎么办,电脑显示“清理请勿关闭计算机”怎么办?...
本文为你提供了3个有效解决电脑显示“清理请勿关闭计算机”问题的方法,并在最后教给你1种保护系统安全的好方法,一起来看看!电脑出现“清理请勿关闭计算机”在Windows 7(SP1)和Windows Server 2008 R2 SP1中,添加了1个新功能在“磁…...
2022/11/19 21:17:03 - 请勿关闭计算机还原更改要多久,电脑显示:配置windows更新失败,正在还原更改,请勿关闭计算机怎么办...
许多用户在长期不使用电脑的时候,开启电脑发现电脑显示:配置windows更新失败,正在还原更改,请勿关闭计算机。。.这要怎么办呢?下面小编就带着大家一起看看吧!如果能够正常进入系统,建议您暂时移…...
2022/11/19 21:17:02 - 还原更改请勿关闭计算机 要多久,配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机,电脑开机后一直显示以...
配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机,电脑开机后一直显示以以下文字资料是由(历史新知网www.lishixinzhi.com)小编为大家搜集整理后发布的内容,让我们赶快一起来看一下吧!配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机&#x…...
2022/11/19 21:17:01 - 电脑配置中请勿关闭计算机怎么办,准备配置windows请勿关闭计算机一直显示怎么办【图解】...
不知道大家有没有遇到过这样的一个问题,就是我们的win7系统在关机的时候,总是喜欢显示“准备配置windows,请勿关机”这样的一个页面,没有什么大碍,但是如果一直等着的话就要两个小时甚至更久都关不了机,非常…...
2022/11/19 21:17:00 - 正在准备配置请勿关闭计算机,正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了解决教程...
当电脑出现正在准备配置windows请勿关闭计算机时,一般是您正对windows进行升级,但是这个要是长时间没有反应,我们不能再傻等下去了。可能是电脑出了别的问题了,来看看教程的说法。正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了方法一…...
2022/11/19 21:16:59 - 配置失败还原请勿关闭计算机,配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机...
我们使用电脑的过程中有时会遇到这种情况,当我们打开电脑之后,发现一直停留在一个界面:“配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机”,等了许久还是无法进入系统。如果我们遇到此类问题应该如何解决呢࿰…...
2022/11/19 21:16:58 - 如何在iPhone上关闭“请勿打扰”
Apple’s “Do Not Disturb While Driving” is a potentially lifesaving iPhone feature, but it doesn’t always turn on automatically at the appropriate time. For example, you might be a passenger in a moving car, but your iPhone may think you’re the one dri…...
2022/11/19 21:16:57