AMiner推荐论文:Artificial intelligence reveals nuclear pore complexity
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细胞核是否具有核膜,是区分真核生物与原核生物的关键。核膜将核内遗传物质与细胞质及其他细胞结构分离开来,使细胞核成为细胞运行的「司令部」。司令部派出的「传令兵」信使 RNA 则需要经过核膜上的核孔离开,其他「补给」也需要经过核孔运送进入细胞核。核孔复合物(NPC)介导核质运输,其错综复杂的架构仍未完全解析。
在这里,密歇根大学、马克斯·普朗克生物物理研究所、欧洲分子生物学实验室等多个组织的研究人员合作,报告了具有显式膜和多种构象状态的人类 NPC 支架的近乎完整的结构模型。
研究人员将基于 AlphaFold 和 RoseTTAfold 的结构预测,与冷冻电子断层扫描以及综合建模相结合。研究表明接头 Nups 在子复合物中和跨子复合物的空间组织支架以建立高阶结构。微秒长分子动力学模拟表明,支架不需要稳定内外核膜融合,而是加宽中心孔隙。该工作举例说明了如何将基于 AI 的建模与原位结构生物学相结合,以了解跨空间组织级别的亚细胞结构。
核孔复合物(NPC)对于细胞核和细胞质之间的运输至关重要,对真核生物中的许多其他细胞过程也至关重要。
在这里,研究人员将来自孤立 NE 和完整细胞内的人类 NPC 的冷冻电子断层扫描(cryo-ET)分析,与基于人工智能的结构预测相结合,从而推断出一个模型;该模型包含 90% 以上的人类 NPC 支架,拥有前所未有的精度和多种构造。
他们证明了基于人工智能的 Nups 模型及其使用 AlphaFold 和 RoseTTAfold 构建的子复合体,与未发布的 X 射线晶体学结构、冷冻电镜图和补充数据一致。阐明了接头 Nups 的精确三维(3D)轨迹、大多数 FG-Nups 的膜结合域的组织和移植位点,收缩和扩张构象。
这是近乎完整的结构模型支持新型分析。它揭示了链接器 Nups 在高阶结构中执行专用的空间组织功能。它能够对嵌入显式膜中的支架进行分子动力学模拟,以说明人类 NPC 支架如何抵消核膜施加的机械力。
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2022/11/19 21:17:01 - 电脑配置中请勿关闭计算机怎么办,准备配置windows请勿关闭计算机一直显示怎么办【图解】...
不知道大家有没有遇到过这样的一个问题,就是我们的win7系统在关机的时候,总是喜欢显示“准备配置windows,请勿关机”这样的一个页面,没有什么大碍,但是如果一直等着的话就要两个小时甚至更久都关不了机,非常…...
2022/11/19 21:17:00 - 正在准备配置请勿关闭计算机,正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了解决教程...
当电脑出现正在准备配置windows请勿关闭计算机时,一般是您正对windows进行升级,但是这个要是长时间没有反应,我们不能再傻等下去了。可能是电脑出了别的问题了,来看看教程的说法。正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了方法一…...
2022/11/19 21:16:59 - 配置失败还原请勿关闭计算机,配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机...
我们使用电脑的过程中有时会遇到这种情况,当我们打开电脑之后,发现一直停留在一个界面:“配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机”,等了许久还是无法进入系统。如果我们遇到此类问题应该如何解决呢࿰…...
2022/11/19 21:16:58 - 如何在iPhone上关闭“请勿打扰”
Apple’s “Do Not Disturb While Driving” is a potentially lifesaving iPhone feature, but it doesn’t always turn on automatically at the appropriate time. For example, you might be a passenger in a moving car, but your iPhone may think you’re the one dri…...
2022/11/19 21:16:57