有2种方法来运行该插件：

您可以使用此选项快速入门。 无需安装或设置，只需单击下面的链接，然后在Web浏览器中通过JupyterNotebook开始使用Slicer。

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-csjZvnij-1591447928235)(https://camo.githubusercontent.com/24c94be25a8a8b5703a34466825bbfdd6147d9d0/68747470733a2f2f6d7962696e6465722e6f72672f62616467652e737667)]

当您单击链接时，Binder将在其云服务器上启动具有SlicerJupyter扩展名的3D Slicer。 Binder是一项免费服务，服务器资源非常有限。 同样，没有交互式访问图形用户界面。 因此，仅建议将该选项用于测试，演示或简单的计算或可视化。

• 创建一个新的Notebook，选择 Slicer 4.x kernel（例如 Slicer 4.11 ）。 当请求启动kernel时，Jupyter会自动打开一个新的Slicer实例。 请求关闭kernel时，此Slicer实例将自动关闭。

• kernel启动时，显示"Kernel starting, please wait…" 消息。 最多几十秒钟后，就应该成功启动Slicerkernel。

• 快速测试-在Notebook中显示视图内容：

import JupyterNotebooksLib as slicernb
slicernb.ViewDisplay()

• 尝试使用交互式视图小部件：

slicernb.ViewInteractiveWidget()

• 按下 Tab 键即可自动补全
• 点击 Shift + Tab 可显示方法文档（多次点击可显示更多详细信息）。 注意：方法名称必须完整（您可以使用 Tab key来补全名称），并且光标必须在名称内或名称之后（而不是括号内）。 例如，键入 slicer.util.getNode 并按 Shift + Tab 。

您可以在 此处 查看 示例SlicerNotebook开始使用 。

• 针对启用了Qt5和VTK9的新建Slicer构建扩展。

• 安装Jupyter

mkvirtualenv -p python3.6 jupyter_env  # Create and activare virtual environmentpip install jupyter

• 安装kernel

jupyter-kernelspec install /tmp/SlicerJupyter-build/inner-build/share/Slicer-4.11/qt-loadable-modules/JupyterKernel/Slicer-4.9/ --replace --user

• 启动Notebook

workon jupyter_env
python -m jupyter notebook

在Slicer的Python控制台中键入此命令，以手动启动Notebook可以连接到的kernel：

connection_file=r'C:\Users\andra\AppData\Roaming\jupyter\runtime\kernel-3100f53f-3433-40f9-8978-c72ed8f88515.json'
print('Jupyter connection file: ['+connection_file+']')
slicer.modules.jupyterkernel.startKernel(connection_file)

connection_file 的路径打印在jupyterNotebook的终端窗口上。

这些命令必须是单元格中的最后命令。

• __kernel_debug_enable(): enable detailed logging of all incoming Jupyter requests
• __kernel_debug_disable(): enable detailed logging of all incoming Jupyter requests