医学领域深度学习模型训练的挑战
2020-05-18 21:29:24
在医学数据集的训练算法期间面临的许多问题中,这三个最常见:
- 类别不均衡
- 多任务
- 数据集大小
对于这些问题,我将分享一些解决问题的技术。
类别不均衡挑战
在现实世界中,我们看到的健康人比患病的人要多得多,这也反映在医学数据集中。健康和患病类别的例子数量并不平均。这反映了疾病在现实世界中的频率。在医疗数据集和信用卡欺诈数据集中,你可能会看到正常样本的数量是异常样本的一百倍。
结果,很容易被误认为是模型表现出色,而实际上却并非如此。如果使用accuracy_score准确度这样的简单度量,就会发生这种情况。准确度对于这类数据集来说不是一个很好的度量标准,因为标签严重倾斜,所以一个只输出正常标签的神经网络的准确率甚至还能略高于90%。
解决方案:
我们可以定义更有用的指标,例如F1度量或"精确度/召回率"。精度定义为"真正例个数/(真正例个数+假正例个数)"。假正例很多时这是一个很好的度量。另一方面,召回率定义为"真正例个数/(真正例个数+假反例个数)"。当假反例本很多时这是一个很好的度量。医疗领域的大多数模型就是这种情况。但是,我们经常需要同时考虑假正例个数和假反例个数,这就是F1度量的功能。它在精确度(Precision)和召回率(Recall)之间取得均衡,由公式2 * ((Precision*Recall) / (Precision+Recall))给出。
处理类不均衡的另一种流行技术是"重采样"。这是从多数类(样本过多的那一类)中删除示例(称为欠采样)或在少数类中添加示例(称为过采样)以在这两个类之间取得均衡的行为。尽管它们可以通过使用复杂的重采样技术来解决,但它们具有自己的缺点,如信息丢失和过拟合。
多任务挑战
在现实世界中,通常仅预测健康或患病是不够的。我们经常需要将医疗数据分为多个类别或标签。例如,仅从心律中检测出心律失常并没有那么有市场,对患者进行分析判断得到哪种心律失常更有价值。例如病状可能是房颤,室上性心动过速或任何其他类型。
从理论上讲,可以为需要分类的每个标签训练单独的神经网络模型,但是这对于写代码来说非常不切实际。如果我们可以将所有这些分类模型组合到一个返回多个预测的单个深度神经网络中,就比较有价值。
解决方案:
我们使用一种称为"多类别分类"或"多标签分类"的方法来应对这一挑战,它们之间略有不同。在多类别中,数据样本的类别是互斥的,而在多标签中,数据样本可以属于多个类别。在医学领域,我们通常使用多标签分类,因为如果患者被诊断为肺不张(肺的膨胀不全),则并不意味着他/她就不会有心脏肥大。我们将模型最后一层的分数再传递给Sigmoid激活函数。这会把最后一层的每个分数转换为0到1之间的值,而与其他分数无关。
对于多标签分类,我们选择的损失函数变为binary_crossentropy,其中由于我们使用了Sigmoid激活函数,因此每个标签都被视为独立的伯努利分布。在需要多类的情况下,可以用损失函数设置为categorical_crossentropy的softmax激活函数来替换Sigmoid激活函数。
数据集大小挑战
处理医学数据集的主要挑战是这些数据集的大小。大型训练数据除了具有良好的体系结构外,还对模型的性能起着重要的作用,并且可用于疾病的患者数据数量往往不够。低数据集大小是导致高偏差和高方差的主要原因。这导致模型的推广和优化困难。
解决方案:
为了解决模型优化的困难,我们使用一种称为"迁移学习"的方法,其中我们使用从相关网络较低层中学习来训练较高层,而无需它们从头开始学习。由于先前的训练,较低的图层可以用作良好的特征提取器,因此我们可以根据数据集对其进行微调。该技术优化速度更快,并减少了训练新模型所需的数据量。
为了解决模型泛化的困难,我们使用一种称为"数据增强"的技术,将数据提供给模型之前,不是复制相同的示例,而是对示例进行一些随机转换。这样,我们可以使模型对于大小或亮度等微小变化保持不变。诸如水平或垂直翻转图像,更改图像的亮度或对比度,将图像旋转或缩放到一定程度之类的做法都有助于数据扩充。此技术在小型数据集中避免过度拟合非常有用。
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2022/11/19 21:17:05 - 配置失败还原请勿关闭计算机怎么办,win7系统出现“配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机”,长时间没反应,无法进入系统的解决方案...
前几天班里有位学生电脑(windows 7系统)出问题了,具体表现是开机时一直停留在“配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机”这个界面,长时间没反应,无法进入系统。这个问题原来帮其他同学也解决过,网上搜了不少资料&#x…...
2022/11/19 21:17:04 - 一个电脑无法关闭计算机你应该怎么办,电脑显示“清理请勿关闭计算机”怎么办?...
本文为你提供了3个有效解决电脑显示“清理请勿关闭计算机”问题的方法,并在最后教给你1种保护系统安全的好方法,一起来看看!电脑出现“清理请勿关闭计算机”在Windows 7(SP1)和Windows Server 2008 R2 SP1中,添加了1个新功能在“磁…...
2022/11/19 21:17:03 - 请勿关闭计算机还原更改要多久,电脑显示:配置windows更新失败,正在还原更改,请勿关闭计算机怎么办...
许多用户在长期不使用电脑的时候,开启电脑发现电脑显示:配置windows更新失败,正在还原更改,请勿关闭计算机。。.这要怎么办呢?下面小编就带着大家一起看看吧!如果能够正常进入系统,建议您暂时移…...
2022/11/19 21:17:02 - 还原更改请勿关闭计算机 要多久,配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机,电脑开机后一直显示以...
配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机,电脑开机后一直显示以以下文字资料是由(历史新知网www.lishixinzhi.com)小编为大家搜集整理后发布的内容,让我们赶快一起来看一下吧!配置windows update失败 还原更改 请勿关闭计算机&#x…...
2022/11/19 21:17:01 - 电脑配置中请勿关闭计算机怎么办,准备配置windows请勿关闭计算机一直显示怎么办【图解】...
不知道大家有没有遇到过这样的一个问题,就是我们的win7系统在关机的时候,总是喜欢显示“准备配置windows,请勿关机”这样的一个页面,没有什么大碍,但是如果一直等着的话就要两个小时甚至更久都关不了机,非常…...
2022/11/19 21:17:00 - 正在准备配置请勿关闭计算机,正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了解决教程...
当电脑出现正在准备配置windows请勿关闭计算机时,一般是您正对windows进行升级,但是这个要是长时间没有反应,我们不能再傻等下去了。可能是电脑出了别的问题了,来看看教程的说法。正在准备配置windows请勿关闭计算机时间长了方法一…...
2022/11/19 21:16:59 - 配置失败还原请勿关闭计算机,配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机...
我们使用电脑的过程中有时会遇到这种情况,当我们打开电脑之后,发现一直停留在一个界面:“配置Windows Update失败,还原更改请勿关闭计算机”,等了许久还是无法进入系统。如果我们遇到此类问题应该如何解决呢࿰…...
2022/11/19 21:16:58 - 如何在iPhone上关闭“请勿打扰”
Apple’s “Do Not Disturb While Driving” is a potentially lifesaving iPhone feature, but it doesn’t always turn on automatically at the appropriate time. For example, you might be a passenger in a moving car, but your iPhone may think you’re the one dri…...
2022/11/19 21:16:57