原标题：达瑞生物开发快速高灵敏 SARS-CoV-2纳米孔靶向测序试剂盒

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国家卫健委发布的《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第六版）》中明确指出：临床诊断病例或疑似病例的确诊需具备“样本中新型冠状病毒核酸检测阳性，或对样本的病毒基因组测序呈现与已知的新型冠状病毒高度同源”的条件。新型冠状病毒全基因组靶向扩增测序，覆盖整个病毒基因组，能大大提高新冠病毒核酸富集效率，显著提高新型冠状病毒诊断的敏感性和特异性。新型冠状病毒是RNA病毒，其RNA基因组复制时的保真性相对较差，容易产生更多的变异。病毒全基因组靶向扩增测序能高效地获取新型冠状病毒全基因组序列信息，为新冠病毒的进化溯源、致病机制、病毒变异、流行病学调研、疫苗研发和防控等提供依据。

达瑞生物与Nanopore 进行深度合作，依托三代测序MinIon 平台，快速开发了 新型冠状病毒2019-nCoV全基因组靶向扩增测序试剂盒（纳米孔测序法），该试剂盒在ARTIC Network国际项目小组提供方案的基础上，进一步优化引物和扩增条件，最终使用97对引物，扩增产物覆盖2019-nCoV的整个基因组，扩增子的平均长度可达800bp ，充分发挥Nanopore 对于长片段测序的优势，可更快更优地获得病毒的基因组信息。

一、可快速确认PCR 假阴性或单靶标阳性样本

新型冠状病毒2019-nCov全基因组靶向扩增测序试剂盒（纳米孔测序法）采用97 个扩增子对新冠病毒进行检测，结合本地化的分析流程，实时高效获取病毒的诊断信息，减少因样本浓度过低或者病毒基因组变异等因素引起的漏检或复检比例， 具有快速、灵敏度高，特异性好的特点，能有效解决核酸检测中假阴性和单靶标阳性问题，其测序结果与二代测序结果相比具有较好的一致性。

二、 可快速获取新型冠状病毒全基因组及变异信息

达瑞生物采用2019-nCoV全基因组靶向扩增测序试剂盒（纳米孔测序法）对66例确诊CDVID的病人样本进行了基因组的组装和变异挖掘，在未使用其它测序技术进行矫正的情况下，均获得了完整的病毒基因组序列。平均有效序列306K （最低130K ，最高710K ），平均测序深度4521X （最低2799X ，最高5587X ），平均基因组均一性高达96.1% （最低82.9% ，最高99.2% ），超过98% 的基因组超过1000X 覆盖（平均99.6% ，最低98.2% ，最高99.8% ）。利用深度学习模型对三代测序结果进行了突变分析，平均每个样本突变位点4 个，非同义突变1.55 个。通过三代测序和二代测序获取的基因组平均一致率超过99.99% （最低99.97% ，最高100% ）。数据表明，纳米孔测序技术能在现场对临床样本进行准确的实时检测，且在短时间内获取高质量的病毒基因组数据和准确的变异信息。

图1：66位患者样本中新型冠状病毒突变数量的分布情况

图2：新型冠状病毒9个编码基因非同义/同义突变的位点数量

图3：新型冠状病毒9个编码基因非同义/同义突变的人次

图4：新型冠状病毒基因组一致率（二代测序（DA8600）VS 三代测序（MinIon））

三、24 种常见呼吸道感染病原体的快速鉴别诊断

多种常见呼吸道病原体所导致的呼吸系统感染的临床表现与CDVID的临床表现相似，造成部分CDVID疑似患者难以确诊。另外，有临床研究表明在CDVID患者中混合其它病原感染的比例约18%，增加了临床诊断和治疗的难度。国家卫健委发布的《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第六版）》中指出新型冠状病毒肺炎要与流感病毒、副流感病毒、腺病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒，人偏肺病毒，SARS冠状病毒等其他已知病毒性肺炎鉴别诊断。达瑞生物基于Nanopore MinIon 三代测序平台开发出24 种常见呼吸道病原体核酸检测试剂盒，可在8 小时完成24 种常见呼吸道病原体的快速鉴别诊断。目前该试剂盒正在进行临床样本测试以及云服务平台的搭建。匠心打造，值得期待！！！

文章来源：达瑞生物

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